虽然最后虽说勉强上了飞机，但三位教授所有携带的书籍和衣物都以违禁物为借口全部被扣在了重庆机场。除了身上的衣服之外，这几位教授和他们的家人，可以说赤手空拳来的东北。
从重庆到东北这一路的飞行，如果不是抗联和延安方面派出的人员悉心照顾，以及早早的便在飞机上配备了医生和药品。连必备的急救药都被抢走的几位夫人，甚至根本就到不了东北。尤其是身体最弱的吴大猷夫人，差一点就病逝在半路之上。面对某些方面的如此刁难，一生倔强的周培源先生，在机场当即落泪。
从几个教授为了治疗自己夫人的肺病，来到东北尚且如此的困难。更别说西南联大整个迁移到东北来。而等到了哈尔滨之后，叶企孙教授才知道，相比几位先生的遭遇，西北联大的几位教授的遭遇更加严重。
那几位准备途径兰州、新疆，转到苏联的教授以及西北联大理学院和工学院毕业的一百多学生，在兰州便被扣了下来。尽管苏联领事馆，以及学校方面多次的交涉，却始终未能被释放，直到现在还在兰州陆军监狱里面关押着。还有为数不少的学子和教师在跨越对陕甘宁边区的封锁线时，大部分都被扣留过，甚至逮捕并被秘密处决。
如此大规模的动员关内教授、讲师、以及学生去延安，或是途径其他地方转到东北，以国民政府对这些大学的监控程度来说，不是一点察觉没有。在很多的时候，中统的嗅觉还是很灵敏的。面对这种情况，国民政府不采取种种的拦截措施，就真的怪了。
除了西北联大师生的遭遇之外，武汉大学、复旦大学、交通大学、兰
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