组阁，真正掌控北京政府的还是袁世凯本人。退一万步来说，袁世凯要杀宋教仁不会做的这么漏洞百出！再者，不能在北京动手，也不至于在上海动手，这两个地方都是政治敏感的区域。要动手也应该在途中。
宋教仁案之后袁世凯和孙中山的态度也让人怀疑，袁世凯一直是主张依法办案，黄兴也赞同这个方式，而孙中山却坚持武力讨伐袁世凯。除此之外孙中山的得力追随者陈其美公然派兵闯入警察局，将宋案档案全部销毁，禁止侦查；关押凶手武士英的上海模范监狱也是属于陈其美治理，不到一个月武士英即暴死狱中。
这一切仅仅是后世史学家的推测，真正幕后凶手是谁毫无定论。
卷二：大革命 第240章，又遭炮击
“哎，我一生致力于民主共和事业，旨在为中华百姓争取幸福平等。从前已经遇到造谣生事之辈，可我相信有朝一日国人会理解。可是今天，却有人要置我于死地，难道我宋教仁致力的事业竟让人误解到了这等地步？”宋教仁悲愤的说道。