是为了骗取同盟会放弃陆军总长一职，而由其亲信段祺瑞充任。因为李汉的蝴蝶影响，袁世凯的损失要比历史上多得多，于是在5月王芝祥到京之后，袁世凯因为唐绍仪的反对，加上不愿意在当时跟同盟会彻底闹僵了，而让其他人得了好处，于是明面上委任他为直隶都督，暗地里却下令王占元等几部驻扎直隶的将领不要与之配合，同时大肆收买王芝祥的直隶军政府麾下官员。
随着几个月的恢复，又搬到了已经开始跟他不是一心的唐绍仪之后。14日，唐绍仪离职的第二日，袁世凯便示意下面有所动作。于是当天晚上，冯国璋、王占元等十余人联名上书袁世凯，声称直隶各路军队对都督王芝祥督直以来的无所作为十分不满，并表示治理位置十分特殊非有“声威兼著，在直隶有年，感情甚孚，及军界素所仰望者，难资镇慑”。
第二天，袁世凯便以军队反对为借口，改委王芝祥为南方军队宣慰使，协助黄兴遣散南方军队。并针对直隶各团体纷纷通电拥护王芝祥，令内阁致电署理都督张锡銮，不准各界“随意迎拒”。
上海、南京、广州、南昌等南方各城市一片谴责声，更有人将唐绍仪辞职跟这件事情联系到一起，于是在报纸上公开揭露袁世凯摧毁内阁，欲实行“拿破仑之目的”。
王芝祥改委事件发生之前的‘唐绍仪辞职事件’便已经让同盟会籍出身的内阁成员感觉到不满而打算辞职了。
7月18日，同盟会总部再次召开会议，强调“此次既系超然内阁，凡本会会员皆不得自由加入，务使本会主张先后一致”。同盟会这一行动，打乱了袁世凯企图利用
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