按下离心离德的葡萄牙人不说，清军于十月初八接收了儋州，但郎伊达的脚步却就此停了下来，一方面郑军大肆掠夺人口造成琼州田园荒芜，清军粮秣必须指望粤省转运，另一方面齐聚琼州府城的剩余乡绅也是郎伊达急于解决的对象。
十月十三日，郎伊达以资寇、通逆的名义抓捕琼山、临高、澄迈、文昌、安定等地琼北士绅一千一百户并五千六百余口。还搞不清清军目的的士绅们纷纷提出以家财劳军的方式偿赎“己罪”，但郎伊达却六亲不认，一场来自“圣君明主”这边的屠杀便就此落到了某些甘心“贝勒爷”奴婢的汉奸头上。
十月十四日，得到补给并完成琼北“清剿”后的清军再度南进，于东线先后夺回了会同、乐会两县，重新逼近郑军在万泉河一线的防线。
此时琼北“清剿”的真实消息还没有传到琼西、琼南，因此昌化、感恩两县也先后叛离明郑的控制区，到了十月十七日，郑军已经只保有万泉河至宁远河之间的沿海地区。
十月二十日，清军四万屯兵万泉河北，但是郎伊达多了一个心眼并没有直接寇关，反而借着自己兵多，兵分两路，自万泉河上游迂回，直逼万州而去，至于郑军关于战争的设想全数落空，不得不提前撤出万州、陵水、崖州一线人员。